从研究问题运行系统性文献综述

一款达到学术医师级别的系统性文献综述工具,构建为一组 Claude Code 技能。任务:一款达到学术医师级别的系统性文献综述工具,构建为一组 Claude Code 技能。给定一个研究问题,它执行专业系统性综述的完整工作流——PICO 构建、多数据库检索、PRISMA 级双轮筛选、引文追踪、质量评估和结构化综合——并生成执行摘要、证据表格以及可导入 Zotero 的引文,适用于高管演示和质量委员会报告。它完全在你的 Claude Code 订阅内运行;不需要 Anthropic API 密钥(Python 后端是一个纯数据层,与免费文献 API 通信,从不与模型通信)。功能包括:通过结构化的“基本四问”访谈进行 PICO(S) 构建,在检索开始前锁定为 PROSPERO 风格的方案;跨 PubMed、OpenAlex 和 Semantic Scholar(Europe PMC 可选)的多源检索,使用 CrossRef 进行 DOI 解析和参考文献列表,并保留完整的 MeSH + 自由文本查询审计轨迹;符合 PRISMA 2020 标准的流水线:去重、双轮摘要筛选、向后/向前引文追踪、全文资格评估以及生成的 PRISMA 流程图;自动获取开放获取 PDF(Unpaywall、PubMed Central、Europe PMC、OpenAlex、CrossRef),其余部分提供引导式手动步骤——不绕过付费墙;研究类型感知的质量评估:AMSTAR-2、Cochrane RoB 2、STROBE、COREQ、SANRA 或专家意见评分标准,根据每篇文章自动选择;NHMRC 证据水平分类(I–IV)以及带有迭代或继续决策点的结构化差距分析;6 个人工检查点,让你可以在会话之间暂停和恢复而不丢失状态;Zotero 就绪输出:RIS + BibTeX 引文文件,与证据表格和叙述综合并列;可选的精美导出:将完成的综述打包为单个 PDF + DOCX 交付物。安装 Python 3.9+(在 3.11 上开发;测试套件也在 macOS 系统 Python 3.9 上通过——CI 不强制要求任何特定版本)。make deploy 将 skills/ 中的每个技能复制到 ~/.claude/skills/{name}/SKILL.md,这是 Claude Code 发现技能所需的文件夹结构。每次拉取技能更改后重新运行它。API 密钥设置 config/api_keys.yaml(gitignored——切勿提交它)包含:每个密钥也可以设置为环境变量:NCBI_API_KEY、OPENALEX_EMAIL、CROSSREF_MAILTO、UNPAYWALL_EMAIL、SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY(旧的 S2_API_KEY 名称仍然有效)。运行综述不需要这些密钥——它们提高速率限制并添加礼貌池访问,每个源都会回退到未认证访问。Semantic Scholar 注意事项:共享的未认证池在很长一段时间内会回答 HTTP 429。没有密钥时,检索会带退避重试,如果池保持饱和,则在检索摘要(degraded_sources / source_status)和 search_log.md 中报告 Semantic Scholar 为降级源,而不是记录静默零。来自 https://www.semanticscholar.org/product/api 的免费密钥可以消除这个问题。用法在此项目目录中打开 Claude Code 并调用以下之一:代理询问你的研究问题,并引导你完成每个阶段。如果你在综述中途关闭 Claude Code,只需再次启动 /lit-review——它会扫描 reviews/ 中的进行中状态并提供恢复。有关完整输出的实际示例——方案、证据表格、执行摘要、PRISMA 流程图、差距分析和引文文件——参见 reviews/d;工具:Claude Code。人工角色:原始帖子没有说明人如何参与。;局限:前提条件包括 Python 3.9+ 和 Claude Code 订阅。不需要 Anthropic API 密钥,但免费文献 API 有速率限制;没有密钥时 Semantic Scholar 可能会返回 HTTP 429 错误。该工具仅自动检索开放获取的 PDF;用户必须手动下载付费墙文章或提交图书馆请求。来源可靠性为次要,因为未提供执行证据。。

工具

Claude Code

Agent Work Atlas 发布日期:

概述

一款达到学术医师级别的系统性文献综述工具,构建为一组 Claude Code 技能。

工作流程

一款达到学术医师级别的系统性文献综述工具,构建为一组 Claude Code 技能。给定一个研究问题,它执行专业系统性综述的完整工作流——PICO 构建、多数据库检索、PRISMA 级双轮筛选、引文追踪、质量评估和结构化综合——并生成执行摘要、证据表格以及可导入 Zotero 的引文,适用于高管演示和质量委员会报告。它完全在你的 Claude Code 订阅内运行;不需要 Anthropic API 密钥(Python 后端是一个纯数据层,与免费文献 API 通信,从不与模型通信)。功能包括:通过结构化的“基本四问”访谈进行 PICO(S) 构建,在检索开始前锁定为 PROSPERO 风格的方案;跨 PubMed、OpenAlex 和 Semantic Scholar(Europe PMC 可选)的多源检索,使用 CrossRef 进行 DOI 解析和参考文献列表,并保留完整的 MeSH + 自由文本查询审计轨迹;符合 PRISMA 2020 标准的流水线:去重、双轮摘要筛选、向后/向前引文追踪、全文资格评估以及生成的 PRISMA 流程图;自动获取开放获取 PDF(Unpaywall、PubMed Central、Europe PMC、OpenAlex、CrossRef),其余部分提供引导式手动步骤——不绕过付费墙;研究类型感知的质量评估:AMSTAR-2、Cochrane RoB 2、STROBE、COREQ、SANRA 或专家意见评分标准,根据每篇文章自动选择;NHMRC 证据水平分类(I–IV)以及带有迭代或继续决策点的结构化差距分析;6 个人工检查点,让你可以在会话之间暂停和恢复而不丢失状态;Zotero 就绪输出:RIS + BibTeX 引文文件,与证据表格和叙述综合并列;可选的精美导出:将完成的综述打包为单个 PDF + DOCX 交付物。安装 Python 3.9+(在 3.11 上开发;测试套件也在 macOS 系统 Python 3.9 上通过——CI 不强制要求任何特定版本)。make deploy 将 skills/ 中的每个技能复制到 ~/.claude/skills/{name}/SKILL.md,这是 Claude Code 发现技能所需的文件夹结构。每次拉取技能更改后重新运行它。API 密钥设置 config/api_keys.yaml(gitignored——切勿提交它)包含:每个密钥也可以设置为环境变量:NCBI_API_KEY、OPENALEX_EMAIL、CROSSREF_MAILTO、UNPAYWALL_EMAIL、SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY(旧的 S2_API_KEY 名称仍然有效)。运行综述不需要这些密钥——它们提高速率限制并添加礼貌池访问,每个源都会回退到未认证访问。Semantic Scholar 注意事项:共享的未认证池在很长一段时间内会回答 HTTP 429。没有密钥时,检索会带退避重试,如果池保持饱和,则在检索摘要(degraded_sources / source_status)和 search_log.md 中报告 Semantic Scholar 为降级源,而不是记录静默零。来自 https://www.semanticscholar.org/product/api 的免费密钥可以消除这个问题。用法在此项目目录中打开 Claude Code 并调用以下之一:代理询问你的研究问题,并引导你完成每个阶段。如果你在综述中途关闭 Claude Code,只需再次启动 /lit-review——它会扫描 reviews/ 中的进行中状态并提供恢复。有关完整输出的实际示例——方案、证据表格、执行摘要、PRISMA 流程图、差距分析和引文文件——参见 reviews/d

原文报告的结果

来源未报告测量结果或成功指标。该工具声称能生成 PRISMA 流程图和结构化综合,但在特定研究问题上的实际表现未知。建议的验收检查:验证测试综述是否生成了有效的 RIS 文件,以及 PRISMA 图表是否与输入数量匹配,且源检索日志中无静默失败。

人工角色

原始帖子没有说明人如何参与。

局限

前提条件包括 Python 3.9+ 和 Claude Code 订阅。不需要 Anthropic API 密钥,但免费文献 API 有速率限制;没有密钥时 Semantic Scholar 可能会返回 HTTP 429 错误。该工具仅自动检索开放获取的 PDF;用户必须手动下载付费墙文章或提交图书馆请求。来源可靠性为次要,因为未提供执行证据。

试一试

我想使用 Claude Code 中的 lit-review-agent 技能对 [可替换的研究问题,例如“远程医疗对慢性疼痛的有效性”] 进行系统性文献综述。首先,通过 'make deploy' 安装技能,并确保 Python 3.9+ 可用。启动 /lit-review 命令。使用“基本四问”访谈引导我完成 PICO 构建。在执行检索前,暂停并向我展示拟议的 PROSPERO 风格方案以供批准。批准后,在 PubMed、OpenAlex 和 Semantic Scholar 上执行多源检索。如果 Semantic Scholar 返回 429 错误,将其记录为降级源,但继续使用其他数据库。去重后,向我展示摘要筛选结果以供我的双轮审查。在我确认纳入的研究之前,不要进入全文资格评估。对于任何没有开放获取 PDF 的纳入研究,为我打开浏览器链接以便手动下载。最后,生成证据表格、PRISMA 流程图和 RIS 引文文件。将所有输出保存到 [可替换的输出目录]。在最终确定之前,向我展示执行摘要和差距分析以供审查。如果任何步骤失败或缺少输入,请向我询问澄清,而不是猜测。

原始来源

来源报告未经独立核验。发布日期为本站案例发布日期,并非原始文章日期。

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